Mivel JTA éves bevétele eddig egyik évben sem haladta meg a 200 millió forintos, vizsgálatra kötelező értékhatárt, ezért az Alapítványnál eddig könyvvizsgálat nem történt. A Jézus Társasága Magyarországi Rendtartománya, mint JTA fenntartó szerve rendszeres, évenkénti, független cég által végzett könyvvizsgálaton esik át.